水稻纹枯病的发生和流行受菌源数量、气象条件、品种抗病性、栽培技术等因素的综合影响。
1. 菌源数量田间残留菌核量与发病初期病情程度呈正相关。上年或上季发病重的田块遗留的菌核多，当年或当季稻株初期发病率高。新垦稻田或上年、上季的轻病田,一般当年或当季发病较轻。
2. 气象因素高温、高湿有利于纹枯病的发生。当日平均气温稳定在22°C、水稻处于分藥期时，田间开始零星发病。我国各稻区主要发病时期有所不同。常年情况下，东南和西南稻区各季水稻生育期均适合病害发生，出现多次发病高峰；华南稻区早稻发病高峰为5〜6月，晚稻为9〜10月；北方单季稻区在7月下旬至8月下旬雨季时病害发生严重；长江中下游地区初夏气温偏高，盛夏多雨，气温偏低，纹枯病发生严重，早稻发病高峰在6月中旬至7月上旬，中、晚稻发病高峰在8月下旬至9月下旬。
1. 菌源数量田间残留菌核量与发病初期病情程度呈正相关。上年或上季发病重的田块遗留的菌核多，当年或当季稻株初期发病率高。新垦稻田或上年、上季的轻病田,一般当年或当季发病较轻。
2. 气象因素高温、高湿有利于纹枯病的发生。当日平均气温稳定在22°C、水稻处于分藥期时，田间开始零星发病。我国各稻区主要发病时期有所不同。常年情况下，东南和西南稻区各季水稻生育期均适合病害发生，出现多次发病高峰；华南稻区早稻发病高峰为5〜6月，晚稻为9〜10月；北方单季稻区在7月下旬至8月下旬雨季时病害发生严重；长江中下游地区初夏气温偏高，盛夏多雨，气温偏低，纹枯病发生严重，早稻发病高峰在6月中旬至7月上旬，中、晚稻发病高峰在8月下旬至9月下旬。
3. 栽培技术氮肥施用量与病害发生程度一般呈正相关。长期深水灌溉，稻丛间湿度大，有利于病菌的滋生和蔓延。水稻种植密度与发病程度有一定关系，但在一定的密度范围（早稻120万丛/hm2，晚稻60万丛/hm2）之内，发病程度差异不大。
4. 品种和生育期目前尚未发现免疫品种，但水稻品种间的抗病性有一定差别。其抗病性一般规律为：粧稻最抗病，粳稻次之，糯稻最感病；窄叶高秆品种较阔叶矮秆品种抗病；迟熟品种较抗病，中熟品种次之，早熟品种最感病，这是由于早熟品种叶鞘内淀粉含量随稻株生长而迅速下降，故垂直扩展速度快，发病较重。另外，植株体内细胞硅化程度高、纤维质和木质素含量高的品种抗病性也相应较强。
4. 品种和生育期目前尚未发现免疫品种，但水稻品种间的抗病性有一定差别。其抗病性一般规律为：粧稻最抗病，粳稻次之，糯稻最感病；窄叶高秆品种较阔叶矮秆品种抗病；迟熟品种较抗病，中熟品种次之，早熟品种最感病，这是由于早熟品种叶鞘内淀粉含量随稻株生长而迅速下降，故垂直扩展速度快，发病较重。另外，植株体内细胞硅化程度高、纤维质和木质素含量高的品种抗病性也相应较强。
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